阿里云新型冠状病毒全基因组分析解决方案

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新型冠状病毒全基因组分析解决方案,阿里云提供病毒全基因组测序分析的整体解决方案,通过算法和模型上的优化,可以在30分钟内完成20人以上的基于全基因组分析的精准筛查。

阿里云新型冠状病毒全基因组分析解决方案

快速地确诊疑似病例成为阻断新冠病毒传染源的重要防治手段,为提高检测的正确性和高效性,阿里云提供病毒全基因组测序分析的整体解决方案,通过算法和模型上的优化,可以在30分钟内完成20人以上的基于全基因组分析的精准筛查。

新型冠状病毒全基因组分析方案架构

新型冠状病毒全基因组分析解决方案
该方案可解决目前全国范围内核酸检测能力不足,PCR方法假阴性率高,以及病毒可能发生变异等关键问题。

架构优势

  • 整合了实验建库、上机测序和数据分析各个环节的最新技术,缩短基因测序检测方法的耗时,提高处理通量。
  • 设计基于AI算法的进化分析和蛋白质结构分析,有助于发现病毒的进化来源、进化时间、三维结构,为病毒疫苗和药物研发提供了基础。
  • 提供web化的操作界面,前端人员能够一键启动样本的分析,直接查看最终报告。

方案优势

快速精准检测,提高地方疫情处理能力
基于全基因组测序方法,保证相关检测准确性,并且能够有效防止病毒变异产生的漏检。整合实验建库、上机测序和数据分析各个环节的最新技术,大大缩短基因测序检测方法的耗时,提高实验室的处理通量。

核心算法优化,全面监控疫情发展和变化

达摩院针对新冠病毒基因的特征进行了分析,基于pdb等公共数据集的数据进行算法的优化训练,设计分布式和并行算法以加速分析流程,提供病毒快速拼接能力。更进一步,设计基于AI算法的进化分析和蛋白质结构分析,有助于发现病毒的进化来源、进化时间、三维结构,为病毒疫苗和药物研发提供了基础。

软硬一体模块化,简化操作和配置,即时部署和使用

方案无缝对接了建库仪,测序仪和计算分析一体机各个部分,实现从样本到报告的完整过程,具备快速部署能力。提供web化的操作界面,前端人员能够一键启动样本的分析,直接查看最终报告。除整套系统外,还能对接客户已有的实验和测序设备。

适用场景

  • 1.为地方疾控中心,医院临检中心,海关等需要管理疫情的机构,建立病毒筛查、诊断和分析能力;
  • 2.为已有实验和测序能力的实验室,提供病毒基因数据筛查、自动化分析和报告、以及研究平台。

关于基因组学分析、三代测序及方案常见问题FAQ等参考官方文档说明:

参考文档

官方文档:新型冠状病毒全基因组分析解决方案

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